پزشکان برای درمان برخی بیماریهای خاص استروئیدهای آنابولیک تجویز میکنند. بهعنوان مثال پزشکان برای جلوگیری از نابودی عضلات در اثر بیماری ایدز، استروئیدهای آنابولیک تجویز میکنند. همچنین ممکن است این استروئیدها برای درمان بلوغ دیررس یا کاهش عملکرد بیضهها نیز تجویز بشود. پزشکان برای بهبود عملکرد ورزشی مجاز به تجویز استروئیدها نیستند.