Mårzï¥ē
کاربر نگاه دانلود
✅ کشف ویروسی شایع در روده انسان با روشهای متاژنومیک و بیوانفورماتیک ✅
وجود ویروسی که در دستگاه گوارش انسان زندگی می کند، بمدت چندین دهه از دید دانشمندان مخفی مانده بود. در این تحقیق که به سرپرستی محققین دانشگاه ایالتی سن دیه گو انجام شد دانشمندان دریافتند که بیش از نیمی از جمعیت جهان میزبان یک ویروس جدیدی بنام crAssphage هستند که یکی از شایع ترین انواع باکتریهای روده ای بنام Bacteriodetes را آلوده می کند.
دانشمندان تصور می کنند که این شاخه از باکتریها با چاقی، دیابت و سایر بیماریهای مرتبط با روده مرتبط می باشند. نتایج این تحقیق در مجله ی Nature Communicationsمنتشر گردید.
دکتر ادواردز، پرفسور بیوانفورماتیک در دانشگاه سن دیه گو و همکارانش کاملاً تصادفی به این کشف دست یافتند. آنها با همکاری با مرکز پزشکی دانشگاه Radboud در هلند، از نتایج مطالعات قبلی بروی ویروس های ساکن روده به منظور شناسایی ویروس های جدید استفاده کردند.
آنها در DNAی نمونه های گرفته شده از 12 نفر، متوجه یک خوشه (cluster) خاص از DNA ویروسی شدند که طول آن حدود 97 هزار جفت باز بود و همه ی نمونه ها دارای این DNAی ویروسی بودند.
این ویروس جدید در نیمی از نمونه های انسانی یافت می شد اما کسی از آن اطلاعی نداشت. به گفته ی دکتر ادواردز این غیر معمول نیست که به دنبال یک ویروس جدید بگردید و آن را بیابید اما این موضوع بسیار غیر معمول است که ویروسی را پیدا کنید که در بسیاری از افراد وجود دارد. این واقعیت که این ویروس در اطلاعات میکروبیومی با این وفور موجود بوده است اما ناشناخته مانده است مایه ی تعجب است. ما اساساً درهر جمعیتی که به دنبال آن گشتیم آنرا پیدا کردیم. این به ما نشان می دهد که قدمت وجود این ویروس به قدمت انسان می رسد.
دکتر ادواردز و گروهش از آنجائیکه از برنامه cross-assembly برای یافتن این ویروس استفاده کردند، نام آن را crAssphage گذاشتند.
بر اساس مطالعات بیوانفورماتیک مشخص شد که این ویروس جدید یک باکتریوفاژ است که باکتریها را آلوده کرده و در داخل باکتریها همانند سازی می کند. آنها با استفاده از تکنیک های نوآورانه ی بیوانفورماتیک پیش بینی کردند که این باکتریوفاژ خاص از طریق آلوده ساختن شاخه ی شایعی از باکتریهای روده ای بنام Bacteriodetes تکثیر می یابد.
باکتریهای Bacteriodetes در انتهای روده زندگی می کنند. دانشمندان به نقش مهم آنها در ارتباط با چاقی مشکوک هستند. اینکه باکتریوفاژ crAssphage چه نقشی در این فرآیند بازی می کند هدف تحقیقات آتی این محققین خواهد بود.
وجود ویروسی که در دستگاه گوارش انسان زندگی می کند، بمدت چندین دهه از دید دانشمندان مخفی مانده بود. در این تحقیق که به سرپرستی محققین دانشگاه ایالتی سن دیه گو انجام شد دانشمندان دریافتند که بیش از نیمی از جمعیت جهان میزبان یک ویروس جدیدی بنام crAssphage هستند که یکی از شایع ترین انواع باکتریهای روده ای بنام Bacteriodetes را آلوده می کند.
دانشمندان تصور می کنند که این شاخه از باکتریها با چاقی، دیابت و سایر بیماریهای مرتبط با روده مرتبط می باشند. نتایج این تحقیق در مجله ی Nature Communicationsمنتشر گردید.
دکتر ادواردز، پرفسور بیوانفورماتیک در دانشگاه سن دیه گو و همکارانش کاملاً تصادفی به این کشف دست یافتند. آنها با همکاری با مرکز پزشکی دانشگاه Radboud در هلند، از نتایج مطالعات قبلی بروی ویروس های ساکن روده به منظور شناسایی ویروس های جدید استفاده کردند.
آنها در DNAی نمونه های گرفته شده از 12 نفر، متوجه یک خوشه (cluster) خاص از DNA ویروسی شدند که طول آن حدود 97 هزار جفت باز بود و همه ی نمونه ها دارای این DNAی ویروسی بودند.
این ویروس جدید در نیمی از نمونه های انسانی یافت می شد اما کسی از آن اطلاعی نداشت. به گفته ی دکتر ادواردز این غیر معمول نیست که به دنبال یک ویروس جدید بگردید و آن را بیابید اما این موضوع بسیار غیر معمول است که ویروسی را پیدا کنید که در بسیاری از افراد وجود دارد. این واقعیت که این ویروس در اطلاعات میکروبیومی با این وفور موجود بوده است اما ناشناخته مانده است مایه ی تعجب است. ما اساساً درهر جمعیتی که به دنبال آن گشتیم آنرا پیدا کردیم. این به ما نشان می دهد که قدمت وجود این ویروس به قدمت انسان می رسد.
دکتر ادواردز و گروهش از آنجائیکه از برنامه cross-assembly برای یافتن این ویروس استفاده کردند، نام آن را crAssphage گذاشتند.
بر اساس مطالعات بیوانفورماتیک مشخص شد که این ویروس جدید یک باکتریوفاژ است که باکتریها را آلوده کرده و در داخل باکتریها همانند سازی می کند. آنها با استفاده از تکنیک های نوآورانه ی بیوانفورماتیک پیش بینی کردند که این باکتریوفاژ خاص از طریق آلوده ساختن شاخه ی شایعی از باکتریهای روده ای بنام Bacteriodetes تکثیر می یابد.
باکتریهای Bacteriodetes در انتهای روده زندگی می کنند. دانشمندان به نقش مهم آنها در ارتباط با چاقی مشکوک هستند. اینکه باکتریوفاژ crAssphage چه نقشی در این فرآیند بازی می کند هدف تحقیقات آتی این محققین خواهد بود.
